Alle Fachabteilungen des Krankenhauses sind nach DIN EN ISO 9001:2008 zertifiziert.

Das Qualitätsmanagementsystem steuert die Gesamtorganisation des Krankenhauses mit allen medizinischen Fach- und Funktionsabteilungen sowie allen Dienstleistungsbereichen (Technische Abteilung, Küche, Schreibbüros etc) bezüglich der Qualität bzw. Qualitätsentwicklung.

Koordiniert wird das Qualitätsmanagement über die Steuerungsgruppe, die sich aus Teilnehmern verschiedener Berufs- und Hierarchiegruppen zusammensetzt. Geleitet wird die Steuerungsgruppe durch eine Stabstelle der Geschäftsführung dem Qualitätsmanagementbeauftragten Jens Ziebold. Die Qualitätspolitik orientiert sich am Leitbild des Krankenhauses.

Einen besonderen Schwerpunkt im Qualitätsmanagement im St. Elisabeth-Krankenhaus bilden: die Patientenorientierung, zum Beispiel durch die Gestaltung reibungsloser Abläufe, Zufriedenheitsmessungen etc.; die Mitarbeiterorientierung, durch Gesundheits- und Arbeitsschutz, gezielte Fortbildungen im Rahmen der Personalentwicklung; sowie die Prozessorientierung, beispielsweise durch verschiedene Projekte der fachübergreifenden Zusammenarbeit immer mit dem Ziel der Qualitätssteigerung der Patientenversorgung.

Es werden gemeinsam Qualitätsziele, mit allen Berufsgruppen des Krankenhauses, definiert und deren Umsetzung bewertet. Durch diesen Qualitätszyklus wird sichergestellt, das an der Qualitätsentwicklung aller Dienstleistungen im Krankenhaus stetig gearbeitet wird. Ebenso nimmt das St. Elisabeth-Krankenhaus seit vielen Jahren an den gesetzlichen Qualitätssicherungsmaßnahmen teil.